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清理iPhone上的短信可以通过以下步骤进行。
1、打开“信息”应用。
2、在界面上，可以看到所有的短信。
3、选择并长按想要删除的短信，直到出现选项。
4、在弹出的选项中，选择“更多”，对于iOS 16及更新版本的系统，长按某条短信后，会出现一个红色的删除按钮，点击即可删除，如果想要删除多条短信，可以在按住某条短信后，点击弹出的“全选”，再点击删除按钮即可，如果短信太多难以选择，可以直接点击左上角的“全选”按钮进行全选操作。
5、在删除确认提示框中，选择“删除”以确认删除所选短信，如果想要清空所有短信，可以直接点击“删除所有短信”选项，需要注意的是，这些操作是不可逆的，一旦删除就无法恢复，所以在删除之前请确保你真的想要删除这些短信，如果不确定是否要删除某些短信，可以先进行备份。
步骤适用于直接通过iPhone的信息应用进行清理，也可以通过使用iTunes或iCloud备份来恢复手机数据并清理短信，还可以使用第三方软件来管理和清理手机中的短信，无论使用哪种方法，都需要谨慎操作以避免误删重要信息。